與國內其他相比較，全能神邪教的組織更加嚴密，主要表現：

一是自上而下建立完整的組織體系。全能神在中國大陸的組織體系，自上而下依次是監察組、牧區、區、小區、教會、小排。并且各級組織中，既有負責發展成員的福音執事，也有負責“洗腦”的講道員，還有負責管理的帶領。全能神組織內部人員分工明確，各司其職。

二是制定了完備的規章制度。譬如《神選民必須遵守的“十條行政”》、《進入信神起碼該具備的“十項實際”》、《達到在試煉中站住見證的“十一條標準”》、《達到辦事有原則必須進入的真理實際》等。在這些規章制度中，主要規定了“女基督”與“大祭司”應當享有的各項權利，譬如享受“祭物”的權利，以及信徒必須盡到的各項義務，譬如“敬拜神”、“高舉神”、“吃喝神話”、“盡本份”、“事奉神”等。

三是對成員分類管理。該邪教制定《教會生活管理原則》，要求根據信徒忠誠度，分為A、B、C組，分別聚會，分類管理。A組成員，是所謂“追求真理”，“甘心盡本份”，“喜愛吃喝神話”的人；B組成員，是所謂“對神話、對生命經歷不開竅的人，聚會中好打岔、好瞌睡的人，說話好抬扛、鉆牛角尖的人，以及不常聚會的所有不追求真理的人”；C組成員是所謂“人性太壞，跟誰都合不來，在教會中不起好作用，被多數人厭憎遠離與對神常有觀念、常有懷疑論斷的人”。

四是對高層骨干進行安全保護。該邪教制定的《教會設立的原則》中明確規定：“設立教會可以由傳福音的人直接設立，也可以由當地教會的傳福執事或澆灌新人的來設立，教會帶領、小區帶領可以幕后指導此事，不要出頭露面”。該邪教強調：“小區帶領、區帶領更要保護好自己，要有更安全的措施，學會在幕后指揮工作，一般情況都不要露面，能叫別人代辦的事就托付別人去辦，如果沒有合適的環境就不要輕易露面”。之于牧區、監察組的成員，安全保護措施更加嚴密。

五是經常性進行內部清洗。該邪教明確規定：“神選民必須清楚的必受懲罰的五大惡行：1、偷吃祭物（凡是把神的祭物占為己有的人）；2、賣主求榮（為大紅龍效力成為撒旦幫兇的人）；3、站地位迷惑人（凡是屬于假帶領假工人不引咎辭職的）；4、搞獨立王國的敵基督（凡是想控制人搞獨立王國的都屬于敵基督）；5、一貫攪擾教會生活的惡人（凡是作惡多端屢教不改的）。凡是犯有五大惡行的人必須開除，永遠開除，神選民應該棄絕他們”。為此，內部經常“清開”。

六是逐層考核，強化組織控制。該邪教要求按照《教會生活安排》等規定中所謂“四個分辨”、“十個區別”、“十項實際”，每年要逐層考核，考核方式是“由上至下，一級考核一級”，譬如監察員考核區帶領與區講道員，區帶領與講道員考核小區帶領與小區講道員，小區帶領與小區講道員考核教會帶領與執事。若不能通過考核，及時撤換。

七是要求該邪教成員，尤其身處重要崗位和擔任重要任務的該邪教成員，要發“毒誓”。相對于各種邪規對該邪教成員的外在他律約束，“毒誓”屬于該邪教成員的內在自律約束。“毒誓”之毒，一在內容惡毒，二在用語惡毒。出于心理學之自我認同，該邪教成員一旦發“毒誓”，為信守誓約起見一般不敢違背，深恐違背誓約會受“神罰”。

八是暴力恐嚇與精神恐嚇并用。全能神邪教經常性威脅其成員，譬如“凡是邪靈敗壞過的我一個都不使用，我一腳踢出去”。又譬如“使用你的時候是我，不用你的時候也是我，萬有都由我擺布，一切都老老實實，規規矩矩地掌握在我手中，誰敢亂動一下，我立即擊殺了你”。再譬如“事奉的事不能亂插手，摻雜己意，否則我要擊殺你，再嚴重的，不好好順服，亂說亂做，剪除你”。除了這種用所謂“閃電擊殺”之類的精神恐嚇威脅成員外，對于所謂“敵基督”、“抵擋神的人”、“猶大”，全能神還使用暴力手段進行傷害，甚至殺害。河南、陜西、山東等一些地方，已經發生多起這類暴力傷害、殺害的案例。

從以上所述可知，全能神邪教較之國內其他邪教，組織更加嚴密，邪惡程度更深，社會危害更大。因此，必須遠離該邪教，一旦陷入其中，再想脫身，絕非易事。之于陷入該邪教泥潭的癡迷者，要盡早醒悟，懸崖勒馬，迷途知迷，否則越陷越深，終將成為該邪教的殉葬品。

據中國反邪教網